RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Компьютерные исследования и моделирование // Архив

Компьютерные исследования и моделирование, 2010, том 2, выпуск 2, страницы 183–187 (Mi crm593)

АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ

Распределение мононуклеотидных повторов в бактериальных хромосомах: A/T-треки преобладают над G/C-треками

С. С. Кисилев, В. М. Комаров, И. С. Масулис, О. Н. Озолинь

Учреждение Российской академии наук Институт биофизики клетки РАН, 142290, Московская обл., г. Пущино, ул. Институтская, д. 3

Аннотация: В данной работе исследовано распределение мононуклеотидных треков разной длины в 342 хромосомах эубактерий и 69 хромосомах архей. Несмотря на то, что число анализируемых повторов проявляет зависимость от нуклеотидного состава, в 73% случаев (301 хромосома, в том числе и в 90 хромосомах, обогащенных GC-парами) было обнаружено преобладание poly(dA)$_n$- и poly(dT)$_n$-треков над poly(dG)$_n$- и poly(dC)$_n$-треками. В природных ДНК число А/Т-треков чаще всего в 2 раза выше, чем в случайных нуклеотидных последовательностях с аналогичным AT/GC- составом и длиной. Обсуждаются возможные причины появления подобной асимметрии в распределениях.

Ключевые слова: мононуклеотидные повторы, A/T-треки, G/C-треки.

УДК: 573; 57:51-76

Поступила в редакцию: 26.05.2010

DOI: 10.20537/2076-7633-2010-2-2-183-187



© МИАН, 2024