Адаптация параллельного вычислительного алгоритма к архитектуре суперЭВМ на примере моделирования динамики плазмы методом частиц в ячейках

Для повышения эффективности использования суперЭВМ и для ускорения проведения расчетов по моделированию турбулентной плазмы в трехмерной постановке существует необходимость динамической, непосредственно в процессе счета, адаптации вычислительного алгоритма к архитектуре суперЭВМ. Проведено большое количество физических расчетов с использованием программы в трехмерной расчетной области, использующей двухступенчатую эйлерово-лагранжеву декомпозицию расчетной области. Для адаптации программы к реально выделенным для ее работы вычислительным узлам в данной работе предложены два подхода. Во-первых, на основании тестовых расчетов на небольшом количестве процессорных ядер измерить время коллективных и парных коммуникаций MPI, построить аппроксимацию времени пересылок для произвольного количества процессов и выбрать оптимальное сочетание эйлеровой и лагранжевой декомпозиции. Во-вторых, необходимо провести анализ коммуникационной структуры выделенных для счета узлов суперЭВМ и перенумеровать процессы с учетом их расположения на узлах.