Optimization of automatic synthesis of benzoxazole phosphoramidate oligonucleotides

Фосфорамидные бензоазольные олигонуклеотиды (ФАО) — недавно разработанные производные нуклеиновых кислот, несущие межнуклеотидные N-(бензоазол)-фосфорамидные остатки. Их можно получить классическим методом автоматического твердофазного фосфитамидного синтеза, в котором стадия окисления заменена реакцией Штаудингера с азидным модификатором. В данной работе проведена оптимизация протокола синтеза N-бензоксазольных олигонуклеотидов. Она заключалась в снижении концентрации азидо-реагента и сокращении времени синтеза. Оптимизированные условия синтеза позволяют снизить расход бензоксазолазида в 2.5 раза, а также сократить на 20 мин время, необходимое для введения единичной модификации при синтезе олигонуклеотида. Полученные преимущества будут использованы для масштабированного синтеза ФАО с целью изучения их в биомедицинских приложениях.