SAXS structure studies of the aptamer to the oncolytic virus VV-GMCSF-Lact

Онколитическая вирусная терапия — сравнительно молодое, но быстро развивающееся направление в терапии рака. Некоторые вирусы могут использоваться для борьбы с раковыми клетками за счет своего цитотоксического действия, но желательно ингибировать влияние на них иммунной системы человека. Аптамеры — короткие олигонуклеотиды, способные специфически связываться со своими молекулярными мишенями, могут выполнять двойную роль: связываться с онковирусами и блокировать их рецепторы, через которые их атакует иммунная система, а также доставлять их к другой мишени — раковым клеткам, для повышения эффективности действия вируса. Для столь сложной задачи критически важно знать трехмерную структуру таких бифункциональных молекул, как аптамеры. В данной работе представлено исследование аптамера NV14t_56 к онколитическому вирусу VV-GMCSF-Lact методом малоуглового рентгеновского рассеяния в растворе, определение структурных характеристик, извлеченных с помощью этого метода, и валидация молекулярной модели, построенной на основе предсказанной вторичной структуры.