RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Журнал Сибирского федерального университета. Серия «Математика и физика» // Архив

Журн. СФУ. Сер. Матем. и физ., 2015, том 8, выпуск 4, страницы 487–496 (Mi jsfu452)

Эта публикация цитируется в 1 статье

An efficient water model for large scale molecular dynamics simulations

[Эффективная модель воды для моделирования больших молекулярных систем]

Viktor E. Zalizniakab

a Institute of Mathematics and Computer Science, Siberian Federal University, Svobodny, 79, Krasnoyarsk, 660041, Russia
b Institute of Computational Modelling SB RAS, Akademgorodok, 50/44, Krasnoyarsk, 660036, Russia

Аннотация: В статье предлагается простая и эффективная, с вычислительной точки зрения, модель воды. Эта одноточечная модель включает в себя потенциал Леннард-Джонса и усреднённое по углам диполь-дипольное взаимодействие. Для параметризации модели используются экспериментальные данные для воды при различных температурах. Основным целевым параметром была выбрана плотность воды. Параметризация проводилась в области температур от 300 до 350 K и давлений до 10.1 МПа. Свойства воды, вычисленные с помощью предлагаемой модели, сравниваются с экспериментальными данными и данными, полученными с помощью модели воды TIP4P/2005. Сравнение показывает, что предлагаемая модель достаточно хорошо воспроизводит выбранные свойства. В статье также приводится вычислительная схема метода молекулярной динамики для NPT ансамбля. Предлагаемая модель не только воспроизводит основные свойства воды, но и требует значительно меньше вычислений по сравнению со стандартными многоточечными моделями воды. Данная модель предназначена для моделирования больших молекулярных систем, возникающих в различных задачах наногидродинамики.

Ключевые слова: модель воды, молекулярная динамика.

УДК: 544.272, 539.6, 532.74

Получена: 10.06.2015
Исправленный вариант: 24.08.2015
Принята: 01.10.2015

Язык публикации: английский

DOI: 10.17516/1997-1397-2015-8-4-487-496



© МИАН, 2024