Программный комплекс L-MOLKERN для расчетов разностей свободных энергий с учетом эффектов перераспределения заряда

Представлен программный комплекс L-MOLKERN для расчетов разностей свободных энергий молекулярных комплексов методом $\lambda$-динамики. Для уточнения расчетов разностей свободных энергий между состояниями с изменением заряда L-MOLKERN использует оригинальный метод учета эффектов перераспределения заряда Net-q. Показаны результаты выполненных расчетов (на примере мутаций белка барназы), демонстрирующие улучшение точности расчетов. Продемонстрирована высокая масштабируемость разработанного программного комплекса L-MOLKERN.