RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2013, том 8, выпуск 2, страницы 529–536 (Mi mbb160)

Эта публикация цитируется в 1 статье

Комментарии

К вопросу о распознавании скрытой периодичности в последовательностях ДНК

Е. В. Коротковab, А. А. Шеленковb, М. А. Коротковаa

a Национальный исследовательский ядерный университет (МИФИ), Москва, 115409, Россия
b Центр «Биоинженерия», Российская академия наук, Москва, 117312, Россия

Аннотация: В данной работе мы сравнили метод информационного разложения (ИР) и спектрально-статистический подход (СС). Мы показываем, что СС подход не учитывает влияния малой выборки, а выделение статистически значимого периода в последовательности оснований ДНК СС подход проводит математически некорректно. Обнаружение «профильной периодичности» СС подходом зависит исключительно от соотношения длин скрытых периодов. Обнаруженные недостатки СС подхода показывают, что для поиска районов ДНК со скрытой периодичностью в нуклеотидных последовательностях более корректно использовать статистику Z и метод ИР.

Ключевые слова: Скрытая периодичность, информационное разложение, спектрально-статистический подход, гены, триплетная периодичность, профильная периодичность.

Материал поступил в редакцию 14.10.2013, опубликован 21.11.2013



© МИАН, 2024