RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2014, том 9, выпуск 1, страницы 112–148 (Mi mbb174)

Обзоры

Экспериментальные и теоретические методы изучения ионных каналов

Д. А. Турченковab, В. С. Быстровac

a Институт математических проблем биологии РАН, Россия, Пущино, 142290, ул. Институтская, д. 4
b НИЦ «БиоСим», Россия, Москва, 115211, Каширское ш., д. 55/3
c Центр исследования керамики и композитов (ЦИКЕКО), Университет Авейро, 3810-193, Авейро, Португалия

Аннотация: В данной работе проводится обзор основных типов и свойств ионных каналов, существующих экспериментальных, теоретических подходов и моделей описания их функционирования. В статье рассмотрены конфигурации методов фиксации потенциала, patch-clamp методика, особое внимание уделено математическим моделям ионных каналов на примере применения методов молекулярной и броуновской динамики, решения уравнения Пуассона–Нернста–Планка, а также современных комбинированных подходов. Существующие ab initio методы квантовой химии представлены теорией функционала плотности (DFT). Для каждой из методик приводятся характерные задачи, решаемые в ее рамках, основные преимущества и недостатки.

Ключевые слова: ионные каналы, моделирование, молекулярная динамика, уравнение Ланжевена, DFT.

УДК: 577:51-7

Материал поступил в редакцию 17.10.2013, опубликован 11.03.2014



© МИАН, 2024