RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2014, том 9, выпуск 2, страницы 438–452 (Mi mbb188)

Математическое моделирование

Индивидуально ориентированная модель для имитации популяционно-генетических процессов у видов, населяющих одномерный ареал

Ю. С. Букинab, А. Л. Горбылевa

a Национальный исследовательский Иркутский государственный технический университет, Иркутск, 664074, Россия
b Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Лимнологический институт СО РАН, Иркутск, 664033, Россия

Аннотация: В работе предлагается имитационная модель, описывающая популяционно-генетические процессы у вида, населяющего одномерный (ленточный) ареал. В процессе имитационного моделирования учитываются: начальное распределение организмов по ареалу; подвижность особей; распределение плотности ресурсов на ареале; вероятность возникновения нуклеотидной замены в митохондриальном и ядерном генетическом маркере; продолжительность имитационного процесса в поколениях. Модель предназначена для «проигрывания» различных сценариев формирования генетического разнообразия. Полученные в ходе моделирования последовательности ДНК можно сравнить с последовательностями ДНК популяционных выборок организмов естественных популяций для проверки гипотез формирования генетического разнообразия. Программно реализованный алгоритм модели и исходный код можно получить по адресу: https://yadi.sk/d/80YAOsvYckiTr.

Ключевые слова: имитационное моделирование, индивидуально ориентированная модель, генетика популяций, популяционные процессы, дрейф генов, потоки генов, мутационный процесс, диффузионные процессы.

Материал поступил в редакцию 08.07.2014, опубликован 04.12.2014



© МИАН, 2024