Идентификация новых потенциальных ингибиторов белка gp41 ВИЧ-1 методами виртуального скрининга и молекулярного моделирования

Проведен виртуальный скрининг химических соединений, способных имитировать фармакофорные свойства моноклонального антитела 10Е8, проявляющего нейтрализующую активность против широкого набора вариантов ВИЧ-1. Методами докинга и молекулярной динамики выполнена оценка эффективности связывания найденных соединений с участком MPER (Membrane-Proximal External Region) белка gp41 ВИЧ-1, ответственным за слияние мембран вируса и клетки-мишени. Обнаружены восемь химических соединений, характеризующихся отрицательными значениями свободной энергии образования структурных комплексов с этим функционально важным участком ВИЧ. Полученные данные свидетельствуют о перспективности использования идентифицированных соединений в работах по созданию новых противовирусных препаратов — ингибиторов слияния ВИЧ, блокирующих участок MPER белка gp41.