RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2017, том 12, выпуск 2, страницы 343–353 (Mi mbb298)

Эта публикация цитируется в 1 статье

Биоинформатика

Структурно-статистические свойства геномов флавивирусов

Ж. С. Тюлькоa, В. А. Кутыркинb, М. Б. Чалейc

a ОмГМУ Минздрава России, Омск, 644099, Россия
b МГТУ им. Н.Э. Баумана, Москва, 107005, Россия
c ИМПБ РАН – филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Московская область, 142290, Россия

Аннотация: На основе спектрально-статистического подхода исследуются основные структурно-статистические свойства кодирующих районов из геномов флавивирусов. Анализируются как полноразмерные кодирующие районы полипротеинов, так и их отдельные структурные сегменты. Показано, что структурно-статистические свойства геномных последовательностей флавивирусов, в целом, аналогичны выявленным ранее свойствам 3-регулярности и скрытой триплетной профильности в кодирующих районах геномов прокариот и эукариот. С другой стороны, в отдельных, кодирующих белки, структурных сегментах из геномов флавивирусов полностью отсутствует двухуровневая организация кодирования, и в их значительной части проявляется свойство однородности последовательности. Такие особенности кодирующих районов флавивирусов объясняются простой структурой и высокой скоростью мутаций их геномов.

Ключевые слова: геном флавивирусов, геном прокариот, геном эукариот, спектрально-статистический подход, скрытая профильная периодичность, свойство 3-регулярности.

УДК: 577.2:519.23

Материал поступил в редакцию 08.09.2017, опубликован 12.10.2017

DOI: 10.17537/2017.12.343



© МИАН, 2024