RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2008, том 3, выпуск 1, страницы 1–15 (Mi mbb33)

Биоинформатика

Поиск регулярных последовательностей в промоторах из геномов различных групп организмов с использованием критерия серий

А. А. Шеленков, Е. В. Коротков

Центр «Биоинженерия» РАН, г. Москва

Аннотация: В статье вводится понятие “регулярность” для описания структурных свойств последовательностей ДНК, расширяющее понятие скрытой периодичности. Предложен метод обнаружения регулярности с использованием критерия серий. Проведенный поиск регулярных последовательностей в эукариотических промоторах показал, что более 60% из них обладают регулярностью на статистически значимом уровне. Обсуждаются возможные биологические функции регулярности и возможность использования данной характеристики для аннотации промоторов.

Ключевые слова: регулярность, промоторы, последовательности ДНК.

УДК: 577.212.2

Материал поступил в редакцию 17.03.2008, опубликован 17.04.2008



© МИАН, 2024