RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2018, том 13, выпуск 2, страницы 507–525 (Mi mbb352)

Эта публикация цитируется в 1 статье

Биоинформатика

Разработка потенциальных ингибиторов ВИЧ-1 методами in silico клик-химии и молекулярного моделирования

А. М. Андриановa, Г. И. Николаевb, И. А. Кашинb, А. В. Тузиковb

a Институт биоорганической химии, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220141, Республика Беларусь
b Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220012, Республика Беларусь

Аннотация: Методами in silico клик-химии – методологии, позволяющей генерировать большое число структур-кандидатов фармацевтических препаратов путем соединения между собой отдельных структурных блоков и изучать их свойства – осуществлен компьютерный дизайн новых потенциальных ингибиторов ВИЧ-1, способных блокировать CD4-связывающий сайт белка gp120 оболочки вируса. С помощью методов молекулярного моделирования проведена оценка нейтрализующей активности сконструированных молекул, в результате которой идентифицировано пять соединений-лидеров, перспективных для синтеза и биологических испытаний. Их химические формулы C$_{24}$H$_{23}$N$_7$O$_2$, C$_{23}$H$_{20}$N$_6$O$_2$, C$_{21}$H$_{17}$F$_{3}$N$_6$, C$_{22}$H$_{20}$ClN$_9$O и C$_{19}$H$_{15}$N$_9$O. Показано, что эти соединения могут быть использованы в качестве базовых структур для разработки новых эффективных анти-ВИЧ препаратов с широкой вирусной нейтрализацией.

Ключевые слова: ВИЧ-1, белок gp120, ингибиторы ВИЧ-1, компьютерное конструирование лекарств, in silico клик-химия, молекулярный докинг, молекулярная динамика.

УДК: 54-3:547:577:616-006

Материал поступил в редакцию 01.10.2018, опубликован 12.12.2018

DOI: 10.17537/2018.13.507



© МИАН, 2024