RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2018, том 13, выпуск 2, страницы 563–590 (Mi mbb356)

Эта публикация цитируется в 3 статьях

Информационные и вычислительные технологии в биологии и медицине

Метод оптимальных разбиений для оценки влияния степени оксигенации гемоглобина на фактор роста эндотелия сосудов

О. В. Сенькоa, М. С. Кодрянb, А. В. Кузнецоваc, Л. Л. Клименкоd, А. И. Деевd, И. С. Баскаковd, А. Н. Мазилинаe

a Федеральный исследовательский центр «Информатика и управление» Российской академии наук, Москва, Россия
b Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Москва, Россия
c Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля, Москва, Россия
d Институт химической физики им. Н.Н. Семенова, Москва, Россия
e Отделение неврологии КБ № 123 ФМБА России

Аннотация: Целью работы является исследование связи фактора роста эндотелия сосудов в сыворотке крови и гипоксией в группах пациентов, страдающих тяжелыми неврологическими заболеваниями. Имеющиеся в литературе данные свидетельствуют об активации синтеза этого белка при гипоксии. Вместе с тем, стандартный корреляционный анализ не позволил достоверно выявить по клиническим данным наличие связи между уровнем фактора роста эндотелия сосудов и параметрами оксиметрии, объективно характеризующими снабжение организма кислородом. В статье представлена методика, позволившая статистически достоверно доказать существование указанной связи, сводящейся к увеличении корреляции между VEGF и комплементом C4, а также между VEGF и белками S100 при снижении уровня оксигенации ниже некоторого порогового значения. Методика включает поиск таких границ для показателей оксиметрии, при которых достигаются максимальные различия по уровню корреляции между VEGF и некоторым дополнительным фактором Z в образуемых группах, а также по возможности максимальный уровень корреляции между VEGF и Z в одной из групп. Использовалась оригинальная методика статистической верификации, основанная на использовании перестановочных тестов, которая позволила не только установить статистическую достоверность эффектов, связанных с отдельными показателями оксиметрии, но и рассчитать совокупную значимость по всем таким показателям. В связи с исследованием возможности использования в качестве дополнительных факторов Z большого числа показателей, потребовалась коррекция с целью учета множественного тестирования.

Ключевые слова: фактор роста эндотелия сосудов, гипоксия, верификация, перестановочный тест, множественное тестирование.

УДК: 004.852

Материал поступил в редакцию 28.08.2018, опубликован 27.12.2018

DOI: 10.17537/2018.13.563



© МИАН, 2024