RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2020, том 15, выпуск 2, страницы 172–179 (Mi mbb430)

Эта публикация цитируется в 1 статье

Математическое моделирование

The reaction path of product release in NO detoxification at the active site of truncated hemoglobin N in MCSCF approach

[Путь реакции высвобождения продукта при детоксикации NO на активном центре усеченного гемоглобина N в теории многоконфигурационного самосогласованного поля]

K. V. Simon, A. V. Tulub

Saint Petersburg State University

Аннотация: Теория мультиконфигурационного самосогласованного поля (МКССП) с оптимизацией геометрии была применена для расчета электронных свойств активного центра гемового ядра усеченного гемоглобина N, в который включена функциональная группа [ONOO] и две молекулы воды. В качестве стартовых были взяты локализованные молекулярные орбитали. Для построения МКССП функций были использованы два подпространства полного взаимодействия. Первое из них включает 3d функции атома железа, второе – связанные и разрыхляющие орбитали пероксинитрита вместе подобными орбиталями O$_2$-фрагмента. Реакция характеризуется двумя переходными состояниями, ее продуктами является нитратный анион [NO$_3$]$^-$ вместе с одной несвязанной молекулой воды. Показано, что существует вероятность образования в качестве продуктов радикалов NO$_2$ и NO.

Ключевые слова: бацилла туберкулеза, структура активного центра гема, пероксинитритная структура, неэмпирический МКССП расчет, переходные состояния, O$_2$/NO химия.

Материал поступил в редакцию 19.06.2020, 19.07.2020, опубликован 03.10.2020

Язык публикации: английский

DOI: 10.17537/2020.15.172



© МИАН, 2024