RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2022, том 17, выпуск 2, страницы 360–385 (Mi mbb494)

Обзоры

Проблемы квантово-классического моделирования первичной фотореакции в родопсине

А. С. Шигаев, И. В. Лихачев, В. Д. Лахно

Институт математических проблем биологии РАН – филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Россия

Аннотация: Исследована модицифированная модель первичной фотореакции в родопсине – цис-транс фотоизомеризации хромофора (ретиналя). Квантовая подсистема модели включает три вибронных состояния: основное состояние, возбуждённое состояние и основное состояние первичного фотопродукта. Данным состояниям соответствуют три точечные массы в классической подсистеме. Модификация заключается в экспоненциальной зависимости электронно-колебательной константы связи от смещения точечных масс. Исследованы свойства оптимальных локусов многопараметрического пространства, для которых характерно наилучшее согласие с экспериментальными данными. Показан достаточно малый “многомерный объём” данных локусов во всех диапазонах используемых значений параметров модели. Предложен ряд путей оптимизации квантово-классической модели фотоизомеризации родопсина.

Ключевые слова: родопсин, хромофор, ретиналь, хромофор, цис-транс фотоизомеризация, поверхность потенциальной энергии, квантово-классическая модель.

Материал поступил в редакцию 27.10.2022, 19.11.2022, опубликован 30.11.2022

DOI: 10.17537/2022.17.360



Реферативные базы данных:


© МИАН, 2024