RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2024, том 19, выпуск 2, страницы 322–337 (Mi mbb562)

Биоинформатика

Моделирование структуры белка tRolC Nicotiana tabacum и его функциональная связь с другими белками

А. Д. Цветковаa, Д. Ю. Швецbc, Х. Г. Мусинc, Б. Р. Кулуевac

a Уфимский университет науки и технологий, Уфа, Россия
b Башкирский государственный медицинский университет, Уфа, Россия
c Институт биохимии и генетики – обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук, Уфа, Россия

Аннотация: Ген trolC является гомологом онкогена rolC Agrobacterium rhizogenes и попал в геном Nicotiana tabacum, вероятнее всего, в результате горизонтального переноса генов. Этот ген довольно консервативен, экспрессируется в молодых органах, однако его функции, как и агробактериального гена rolC, остаются неизвестными. В настоящей работе проанализирована предположительная структура белка tRolC Nicotiana tabacum, предсказанная с помощью сервиса I-TASSER. Наличие у белка tRolC аминокислотных остатков активного центра и сайта связывания, а также белок-связывающей и ARTT-петли, сходных по структуре с белком 6b Agrobacterium vitis, свидетельствует о выполнении ими сходных биологических функций. На основе полученных данных высказана гипотеза о наличии у белка tRolC АДФ-рибозилтрансферазной активности, позволяющей ему влиять на рост и устойчивость растений к стрессам, а также на биосинтез вторичных метаболитов посредством влияния на регуляцию экспрессии генов через взаимодействие с факторами транскрипции, компонентами РНК-интерференции или проявление гистоноподобной активности.

Ключевые слова: Agrobacterium rhizogenes, rol-гены, rolC, белок 6b, АДФ-рибозилтрансферазы, компьютерное моделирование.

Материал поступил в редакцию 08.08.2024, 16.09.2024, опубликован 28.09.2024

DOI: 10.17537/2024.19.322



© МИАН, 2025