Биоинформатика
Моделирование структуры белка tRolC Nicotiana tabacum и его функциональная связь с другими белками
А. Д. Цветковаa,
Д. Ю. Швецbc,
Х. Г. Мусинc,
Б. Р. Кулуевac a Уфимский университет науки и технологий, Уфа, Россия
b Башкирский государственный медицинский университет, Уфа, Россия
c Институт биохимии и генетики – обособленное структурное подразделение
Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского
федерального исследовательского центра Российской академии наук, Уфа, Россия
Аннотация:
Ген
trolC является гомологом онкогена
rolC Agrobacterium rhizogenes и попал в геном
Nicotiana tabacum, вероятнее всего, в результате горизонтального переноса генов. Этот ген довольно консервативен, экспрессируется в молодых органах, однако его функции, как и агробактериального гена
rolC, остаются неизвестными. В настоящей работе проанализирована предположительная структура белка tRolC
Nicotiana tabacum, предсказанная с помощью сервиса I-TASSER. Наличие у белка tRolC аминокислотных остатков активного центра и сайта связывания, а также белок-связывающей и ARTT-петли, сходных по структуре с белком 6b
Agrobacterium vitis, свидетельствует о выполнении ими сходных биологических функций. На основе полученных данных высказана гипотеза о наличии у белка tRolC АДФ-рибозилтрансферазной активности, позволяющей ему влиять на рост и устойчивость растений к стрессам, а также на биосинтез вторичных метаболитов посредством влияния на регуляцию экспрессии генов через взаимодействие с факторами транскрипции, компонентами РНК-интерференции или проявление гистоноподобной активности.
Ключевые слова:
Agrobacterium rhizogenes, rol-гены, rolC, белок 6b, АДФ-рибозилтрансферазы, компьютерное моделирование.
Материал поступил в редакцию 08.08.2024, 16.09.2024,
опубликован 28.09.2024
DOI:
10.17537/2024.19.322