RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2011, том 6, выпуск 2, страницы 264–272 (Mi mbb80)

Математическое моделирование

Адиабатическое приближение при расчетах подвижности заряда в холстейновской модели ДНК

Д. А. Тихонов, Е. В. Соболев, В. Д. Лахно, Н. С. Фиалко

Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, г. Пущино, Московская область, 142290, Россия

Аннотация: В холстейновской модели распространение заряда (квантовой частицы) вдоль цепочки сайтов и движения классических сайтов цепочки описывается самосогласованной системой ОДУ (поляронная модель). Для расчета подвижности заряда при заданной температуре окружающей среды рассмотрено линейное адиабатическое приближение, при котором движение заряда не влияет на смещения сайтов. В этом приближении расчет значительно ускоряется. Проведенное сравнение результатов расчета поляронной и рассматриваемой адиабатической моделей дает совпадающие величины коэффициента диффузии с точностью до стандартной ошибки среднего.

Ключевые слова: модель Холстейна, уравнение Ланжевена, подвижность, ДНК, адиабатическое приближение, метод Магнуса, аппроксимация матричной экспоненты.

УДК: 519.6

Материал поступил в редакцию 24.11.2011, опубликован 28.11.2011



© МИАН, 2024