RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическое моделирование и численные методы // Архив

Мат. моделир. и числ. методы, 2017, выпуск 15, страницы 119–138 (Mi mmcm110)

Стохастические модели кодирования и распознавание структурно-статистических характеристик кодирующих последовательностей

В. А. Кутыркинa, М. Б. Чалейb

a Московский государственный технический университет имени Н. Э. Баумана
b Институт математических проблем биологии РАН, г. Пущино

Аннотация: Предложены стохастические модели, объясняющие реальные характерные закономерности кодирующих районов из геномов различных организмов. Вследствие нарастающего объема данных по секвенированным геномам возникает проблема их автоматизированного анализа. С использованием этих моделей разработаны методы распознавания структурно-статистических свойств геномных последовательностей ДНК, которые могут быть использованы для разработки алгоритмов и компьютерных программ для автоматизированной обработки большого объема данных. Свойства предложенных стохастических моделей кодирования продемонстрированы в численных экспериментах с бинарно перекодированными абзацами литературных произведений на английском и итальянском языках.

Ключевые слова: профиль случайной строки, профильная периодичность, паттерн профильной периодичности, стохастический кодон, мультиполиномиальная модель.

УДК: 519.25

DOI: 10.18698/2309-3684-2017-3-119138



© МИАН, 2024