А. В. Белашов, Д. А. Горбенко, А. А. Жихорева, Т. Н. Беляева, Е. С. Корнилова, И. В. Семенова, О. С. Васютинский, “Разработка алгоритмов сегментации в голографической микроскопии и томографии для определения морфологических параметров клеток”, Письма в ЖТФ, 2019, том 45, выпуск 22,страницы 24

Эта публикация цитируется в 6 статьях

Разработка алгоритмов сегментации в голографической микроскопии и томографии для определения морфологических параметров клеток

А. В. Белашов^a, Д. А. Горбенко^ab, А. А. Жихорева^a, Т. Н. Беляева^c, Е. С. Корнилова^c, И. В. Семенова^a, О. С. Васютинский^a

^a Физико-технический институт им. А.Ф. Иоффе Российской академии наук, г. Санкт-Петербург
^b Санкт-Петербургский национальный исследовательский университет информационных технологий, механики и оптики
^c Институт цитологии РАН, г. Санкт-Петербург

Аннотация: Разработаны алгоритмы сегментации клеток на двумерных фазовых изображениях и трехмерных распределениях показателя преломления, полученных соответственно методами цифровой голографической микроскопии и томографии. Алгоритмы оптимизированы для определения морфологических параметров клеток, в том числе объема, площади проекции, площади поверхности. Проведен сравнительный анализ погрешности определения объема клеток голографическими методами с использованием разработанных алгоритмов сегментации и эталонным методом конфокальной флуоресцентной микроскопии.

Ключевые слова: голографическая микроскопия, голографическая томография, морфологические характеристики клеток, сегментация клеток.

Поступила в редакцию: 15.07.2019
Исправленный вариант: 24.07.2019
Принята в печать: 24.07.2019

DOI: 10.21883/PJTF.2019.22.48644.17980