RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Вычислительные методы и программирование // Архив

Выч. мет. программирование, 2013, том 14, выпуск 3, страницы 292–294 (Mi vmp115)

Эта публикация цитируется в 1 статье

Вычислительные методы и приложения

Увеличение размерности в методе докинга на основе тензорных поездов

Д. А. Желтковa, Е. Е. Тыртышниковb

a Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, факультет вычислительной математики и кибернетики
b Институт вычислительной математики РАН

Аннотация: Предложена модификация метода докинга на основе тензорных поездов с использованием идеи искусственного увеличения размерности при поиске положения молекулы-лиганда, минимизирующего энергию системы белок-лиганд. Проведено сравнение с программой TTDock (докинг на основе тензорных поездов), не использующей искусственное увеличение размерности. Результаты тестирования показывают, что при той же надежности предложенная модификация в 5–10 раз вычислительно менее затратна, чем TTDockю

Ключевые слова: тензорный поезд; искусственное увеличение размерности; крестовый метод; глобальная оптимизация; докинг; компьютерный дизайн лекарств.

УДК: 519.6

Поступила в редакцию: 15.04.2013



© МИАН, 2024