Параллельная молекулярная динамика с суммированием Эвальда и интегрированием на графических процессорах

Рассмотрена задача молекулярно-динамического моделирования при периодических граничных условиях. Обсуждаются эффективные алгоритмы для метода суммирования Эвальда. Предложены параллельные реализации на основе технологии NVIDIA CUDA. Исследован вопрос интегрирования уравнений движения на графических процессорах с одинарной и двойной точностью плавающей арифметики. На видеокарте NVIDIA GeForce GTX 280 достигнуто удельное (на одну систему) ускорение до $\approx 890$ раз по сравнению со скалярным расчетом на процессоре Intel Core2 Quad Q9550.