RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Вычислительные методы и программирование // Архив

Выч. мет. программирование, 2006, том 7, выпуск 4, страницы 310–322 (Mi vmp607)

Вычислительные методы и приложения

Энтропическое моделирование полимерных цепей с фиксированным валентным углом

А. А. Юрченко, П. Н. Воронцов-Вельяминов

Санкт-Петербургский государственный университет

Аннотация: В настоящей работе представлены результаты исследования моделей полимерных цепей с фиксированным валентным углом. Вычислительный эксперимент проводился методом Монте-Карло с использованием алгоритма Ванга-Ландау. Для моделей предельных углеводородов и полипептидов (полиглицинов) получены функции распределения по энергиям, которые позволили рассчитать средние канонические значения внутренней энергии, теплоемкости, избыточной энтропии, радиуса инерции и расстояния между концами полимерной цепи. Для построения модели предельных углеводородов использовались параметры силового поля OPLS, для полиглицина - параметры силового поля CHARMM. Работа выполнена при поддержке РФФИ (код проекта 05-02-17428).

Ключевые слова: методы Монте-Карло; моделирование; алгоритм Ванга-Ландау; полимеры; полипептиды; термодинамика; силовое поле.

УДК: 537.213



© МИАН, 2024