RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Вычислительные методы и программирование // Архив

Выч. мет. программирование, 2018, том 19, выпуск 4, страницы 327–339 (Mi vmp923)

Моделирование деления биологических клеток в стадии метафазы на суперкомпьютере “Ломоносов-2”

М. А. Кривовa, А. В. Зайцевb, Ф. И. Атауллахановb, П. С. Ивановc

a Московский государственный университет имени М. В. Ломоносова, факультет вычислительной математики и кибернетики
b Центр теоретических проблем физико-химической фармакологии РАН, Москва
c Физический факультет, Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова

Аннотация: Статья посвящена проблеме построения математической модели биологической клетки, описывающей процесс ее деления в рамках $M$-фазы. Рассмотрено предложенное авторами уточнение одной из известных моделей путем перехода с двумерного на трехмерный случай. Модифицированная модель реализована в виде универсального программного комплекса для моделирования деления клеток в стадиях прометафазы, метафазы и анафазы на локальных машинах и суперкомпьютерах. С его помощью на кластере “Ломоносов-2” изучено влияние размера активной области кинетохора на количество меротельных зацеплений в стадии метафазы. Показано, что наблюдаемая зависимость проявляется не столько из-за геометрических ограничений, как предполагалось ранее, сколько из-за больших углов разворота пар хромосом.

Ключевые слова: митоз, метафаза, кинетохор, меротельные микротрубочки, математическое моделирование, суперкомпьютер.

УДК: 576.353.25+004.942

Поступила в редакцию: 22.06.2018



© МИАН, 2024