RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Вестник Санкт-Петербургского университета. Серия 10. Прикладная математика. Информатика. Процессы управления // Архив

Вестн. С.-Петербург. ун-та. Сер. 10. Прикл. матем. Информ. Проц. упр., 2023, том 19, выпуск 4, страницы 469–483 (Mi vspui596)

Прикладная математика

Автоматическое получение «упрощенной лейкоцитарной формулы» методами проточной цитофлуориметрии и кластерного анализа

А. В. Орехов, В. И. Шишкин, Г. В. Кудрявцева, Г. В. Павилайнен, В. В. Шишкин, Н. С. Людкевич

Санкт-Петербургский государственный университет, Российская Федерация, 199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7–9

Аннотация: Лейкоцитарная формула — это процентное отношение основных групп белых клеток крови (лейкоцитов). По морфологическим признакам среди лейкоцитов можно выделить три субпопуляции: лимфоциты, моноциты и гранулоциты, последние разделяют на нейтрофильные, эозинофильные и базофильные клетки. Автоматическая типологизация белых клеток крови является нерешенной задачей, поэтому при их цитометрическом исследовании подсчет количества клеток в различных субпопуляциях лейкоцитов фактически производится вручную, что, в свою очередь, обусловливает субъективность эксперимента и большие значения погрешностей при вычислениях. Для решения проблемы автоматической типологизации белых клеток крови предпринимались попытки использования методов кластерного анализа. В вычислительных экспериментах было показано, что применение стандартных алгоритмов, таких как метод К-средних, EM-алгоритм, DBSCAN и т. п., не эффективно. За последние годы опубликовано большое количество исследовательских работ, в которых описываются специализированные алгоритмы кластеризации для обнаружения и определения субпопуляций белых клеток крови, некоторые из них нашли практическое применение, но по-прежнему актуальными остаются проблемы, связанные с наличием значительного количества шумов и с различной плотностью распределения данных при кластеризации лейкоцитов методами проточной цитометрии. Рассматривается подход к построению стратегии автоматического выделения лимфоцитов, моноцитов и гранулоцитов при помощи модифицированного агломеративного центроидного метода кластеризации. Обсуждаются результаты вычислительных экспериментов.

Ключевые слова: лейкоцитарная формула, проточная цитометрия, кластерный анализ, марковский момент, метод наименьших квадратов.

УДК: 519.237.8+519.654+57.083.1

MSC: 92С37

Поступила: 27 мая 2023 г.
Принята к печати: 12 октября 2023 г.

DOI: 10.21638/11701/spbu10.2023.404



© МИАН, 2024